雖然，我國不同的科研機構(gòu)的研發(fā)項目管理體系不盡相同，存在的問題也多種多樣，但是長期的事業(yè)單位管理體制，導(dǎo)致科研機構(gòu)在研發(fā)項目管理中普遍存在下述問題：

　　1.研發(fā)戰(zhàn)略

　　*缺乏明晰的戰(zhàn)略定位及發(fā)展規(guī)劃，沒有明確的項目選擇標(biāo)準(zhǔn)

　　*缺乏市場需求分析和產(chǎn)品(研發(fā)項目)組合管理

　　*重視產(chǎn)品開發(fā)，但是忽視研發(fā)平臺構(gòu)造

　　2.

　　*經(jīng)驗型管理，缺乏對業(yè)務(wù)流程的清晰定義，導(dǎo)致管理失控，或者效率降低

　　*各部門各自為政，流程不能得到有效執(zhí)行，有效的信息大量流失

　　*流程不能根據(jù)業(yè)務(wù)發(fā)展需要調(diào)整，冗余環(huán)節(jié)多，效率低下

　　*支撐業(yè)務(wù)流程不以研發(fā)工作為核心，對研發(fā)工作需求響應(yīng)不及時

　　*對項目計劃不重視，計劃制定時不夠?qū)徤?，?zhí)行過程中變更頻繁，不能發(fā)揮對工作的指導(dǎo)和評估作用，

　　*缺乏對項目控制的系統(tǒng)思考，控制環(huán)節(jié)不全面，過程不系統(tǒng)

　　*沒有統(tǒng)一的項目術(shù)語定義，容易造成業(yè)務(wù)和管理混亂

　　*沒有進(jìn)行項目階段劃分，或者沒有明確各階段的產(chǎn)出、考核標(biāo)準(zhǔn)和內(nèi)容，沒有確定項目各階段中的關(guān)鍵決策點和決策點控制制度

　　*缺乏過程中止管理，項目一旦開始往往很難中止

　　3.項目組織模式

　　*沒有全過程的負(fù)責(zé)人，或負(fù)責(zé)人不能協(xié)調(diào)項目所需的人、財、物

　　*在采用矩陣式項目組織模式時，部門經(jīng)理和項目經(jīng)理的職責(zé)劃分不清，二者的工作缺乏協(xié)調(diào)機制

　　4.人員管理

　　*項目經(jīng)理通常是技術(shù)人員，缺乏必要的項目管理知識和技能

　　*一個項目經(jīng)理帶多個項目，精力不能滿足項目需要，同時其他人員因缺乏晉升機會而積極性不高

　　*項目組中缺少市場和銷售人員，不能及時掌握市場動態(tài)和客戶需求

　　*績效考核機制不能激勵骨干技術(shù)人員

　　5.電子文檔管理系統(tǒng)

　　*沒有機制或者知識管理系統(tǒng)，無法滿足不同項目的科研人員間的知識共享需求，容易導(dǎo)致重復(fù)開發(fā)

　　*缺乏知識產(chǎn)權(quán)管理概念和管理體系，尤其容易忽略項目過程中的知識產(chǎn)權(quán)管理

　　*知識保密意識較差，知識泄密事件頻頻發(fā)生

　　6.資金管理

　　*項目預(yù)算不規(guī)范、不準(zhǔn)確，不能作為項目控制的有效工具

　　*過于追求技術(shù)的先進(jìn)性，忽略研發(fā)成本

　　*成本核算體系不能支撐項目核算需要，無法準(zhǔn)確核算項目成本

　　*缺乏階段性成本控制制度，項目預(yù)算超支現(xiàn)象普遍

　　*缺乏對項目組的財務(wù)績效考核指標(biāo)，項目組不重視成本控制

　　7.項目績效評價

　　*缺乏績效評價體系，或績效評價體系不夠科學(xué)和細(xì)致

　　*績效評價指標(biāo)體系不能體現(xiàn)研發(fā)戰(zhàn)略和價值觀

　　*績效評價指標(biāo)體系中缺乏經(jīng)濟(jì)指標(biāo)

　　*績效評價指標(biāo)體系中缺乏過程性指標(biāo)

　　*績效評價指標(biāo)體系中定量指標(biāo)過少

　　*績效評價結(jié)果不能與研發(fā)項目組成員的績效考核掛鉤，不能反映其薪酬和職務(wù)變動

　　*績效評價結(jié)果不能反映到項目組織模式、管理控制辦法、項目選擇標(biāo)準(zhǔn)的調(diào)整中

　　上述問題，往往會導(dǎo)致科研機構(gòu)的項目失敗率過高、成果轉(zhuǎn)化率過低、技術(shù)人員積極性不高、技術(shù)人員流失嚴(yán)重、研發(fā)成本居高不下等結(jié)果，甚至導(dǎo)致科研機構(gòu)的破產(chǎn)倒閉。